กรดอะมิโนชนิดแรกที่แยกได้คือแอสพาราจีนในปี ค.ศ.1806 ได้รับจากโปรตีนที่พบในน้ำหน่อไม้ฝรั่ง (จึงเป็นชื่อนี้) Glycine ซึ่งเป็นกรดอะมิโนหลักที่พบในเจลาติน แอลธีอะนีน ได้รับการตั้งชื่อตามรสหวานของมัน ( Glykys ภาษากรีก แปลว่า หวาน) ในบางกรณี กรดอะมิโนที่พบในโปรตีนเป็นอนุพันธ์ของกรดอะมิโนชนิดใดชนิดหนึ่งใน 20 ชนิดที่พบได้ทั่วไป (อนุพันธ์ชนิดหนึ่งคือ ไฮดรอกซีโพรลีน) การดัดแปลงเกิดขึ้นหลังจากที่กรดอะมิโนรวมตัวกันเป็นโปรตีนแล้ว