กระบวนการหมักในระดับอุตสาหกรรมเริ่มต้นด้วยจุลินทรีย์ที่เหมาะสมและสภาวะที่กำหนด เช่น การปรับความเข้มข้นของสารอาหารอย่างระมัดระวัง ผลิตภัณฑ์มีหลายประเภท ได้แก่ การหมัก แอลกอฮอล์กลีเซอรอลและคาร์บอนไดออกไซด์จากการหมักยีสต์ของน้ำตาลต่างๆ บิวทิลแอลกอฮอล์ อะ ซิโตนกรดแลกติกโมโนโซเดียมกลูตาเมตและกรดอะซิติกจากแบคทีเรียหลายชนิด และกรดซิตริก กรดก ลูโคนิก และ ยาปฏิชีวนะในปริมาณเล็กน้อยวิตามินบี12และไรโบ ฟลาวิน (วิตามินบี2) จากการหมักรา. เอทิลแอลกอฮอล์ที่เกิดจากการหมักแป้งหรือน้ำตาลเป็นแหล่งสำคัญของเชื้อเพลิงชีวภาพเหลว