การทำปุ๋ยหมักเป็นกระบวนการย่อยสลายอินทรียวัตถุในมูลสัตว์ เศษพืชผล หรือของเสียจากฟาร์ม โดยกลุ่มจุลินทรีย์ผสมในสภาพแวดล้อมที่มีอากาศอบอุ่นและชื้น สารอินทรีย์ถูกย่อยสลายโดยการกระทำของแบคทีเรีย เชื้อรา และแอคติโนมัยสีทอย่างต่อเนื่อง ในขั้นตอนสุดท้ายของการย่อยสลาย หนอนแดง (หรือมูลไส้เดือน) ช่วยในการผลิตฮิวมัสที่เสถียรซึ่งมีประโยชน์ในฐานะปุ๋ยอินทรีย์ การผลิตก๊าซชีวภาพ การเลี้ยงสัตว์  ก๊าซชีวภาพผลิตขึ้นโดยการย่อยแบบไม่ใช้ออกซิเจนหรือการหมักวัสดุที่ย่อยสลายได้ทางชีวภาพจากโรงเรือนเลี้ยงสัตว์ เช่น มูลสัตว์และของเสียจากสัตว์ ก๊าซชีวภาพประกอบด้วยก๊าซมีเทน (CH4) และก๊าซคาร์บอนไดออกไซด์ (CO2) เป็นหลัก ซึ่งสามารถนำไปใช้ในการหุงต้มและให้แสงสว่างได้ให้อาหารและน้ำสะอาดแก่สัตว์ วางชามน้ำดื่มและตะแกรงให้สูงจนมูลสัตว์และปัสสาวะไม่สามารถตกลงไปในอาหารและน้ำได้ • เอาอุจจาระออกจากคอกสัตว์บ่อยๆ (อย่างน้อยวันละครั้ง) • อย่าปล่อยให้สัตว์แออัดเกินไป ฉีดวัคซีนป้องกันโรคสำคัญที่แพร่หลายในภูมิภาค • ระวังซาก ฝังหรือเผาสัตว์ที่ตายแล้ว • ตรวจสอบให้แน่ใจว่าอากาศในคอกมีการถ่ายเทดี การระบายอากาศช่วยขจัดความชื้นและความชื้นเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับแบคทีเรียเพื่อการอยู่รอด การเจริญเติบโต และการเพิ่มจำนวน • อย่านำสัตว์ที่แข็งแรงมาปะปนกับสัตว์ที่เป็นโรค สัตว์ที่ซื้อมาใหม่จะต้องแยกออกจากฝูงเป็นเวลาสองสามสัปดาห์และต้องได้รับการตรวจติดตามว่าเป็นโรคหรือไม่